治疗鸡大肠杆菌病的常用药物有庆大霉素、诺氟沙星、头孢拉定、安普霉素、氟苯尼考和头孢噻呋。山东省某兽药厂刘实验员曾进行过“有益微生物防治鸡大肠杆菌病”实验。试验组按0.1%的比例提前一周向鸡饮水中添加EM菌。实验组人工感染相同剂量的大肠杆菌。同时以大肠杆菌菌株作为对照组。结果表明,试验组病鸡和死鸡的发生率均显著低于对照组,且与对照组比较差异有显著性结果表明,在发病前饮用水中添加0.1%的EM菌,其保护率可达96.7%。因此,在饮用水中添加0.1%的EM菌可以预防鸡大肠杆菌病。在使用EM菌期间,禁止EM菌与其他抗生素合用。